Fedora Core 5 peeglitesse jõudis uus 2.6.16-1.2080_FC5 kernel, mida uue Fedora väljalaskmisest saati paljud kasutajad pikalt oodanud on. Nimelt Fedora Core 5 originaalkernel ei toetanud mitte-GPL mooduleid ning seetõttu ei olnud võimalik näiteks installida populaarseid Livna ntfs, ati ja nvidia draivereid.